慢性应激诱导差异表达基因数据库软件

  • 英 文 名 称 :CS-DEGs
  • 简 称 :CS-DEGs
  • 简 介 : 鉴于应激环境造成的许多微观变化很难在人体直接观测,啮齿类动物模型成为了我们观测慢性应激环境引发表观遗传学变化的主要信息来源。然而这些信息散在于不同来源、不同类型的文献报道中,不加以整合无法进行更深入的分析。所以我们系统搜集整理了PubMed收录的报道啮齿类动物慢性应激环境环境模型下基因表达差异的195篇文献,将文献中报道的815个差异表达基因进行汇总整合,并寻找它们在人类及其他啮齿类动物中的同源基因,这些基因被命名为慢性应激相关基因(CS genes)。基于CS genes 我们又进行了更进一步的深入分析。上述CS genes 及基于CS genes的分析结果均存储于公共数据库 CS-DEGs(http://cd.psych.ac.cn)中。作为全球慢性应激研究领域首个基因数据库,CS-DEGs为研究者提供了慢性应激表观遗传学研究的基础全貌,有利于研究者将啮齿类动物表达研究的结果应用到人类应激相关疾病的研究中去,并为这些研究提供了较为可靠的候选基因与生物学通路。
  • 学 科 :基因
  • 资 源 类 型 :数据集,工具集
  • 起 始 时 间 :2013-12-17 -
  • 访 问 地 址 :http://cs.psych.ac.cn/