双相情感障碍遗传学数据库

英 文 名 称 :BDgene

简 称 :BDgene

简 介 : 双相情感障碍（BD）是一种常见的精神类疾病，又称狂躁抑郁症，常狂躁和抑郁症状交替发作。已有研究证明该病具有复杂的遗传结构，遗传度估计在80%到85%之间。目前已经有大量相关的遗传学研究，鉴定了一系列疾病相关的位点和基因，但很多结果之间存在很大的不一致性，而且单个基因只能解释很小的遗传度。另一方面，该疾病经常与精神分裂症（SZ）和重度抑郁症（MDD）共享一些临床特征，并存在一定的共发性。家系研究也表明这三者之间存在共同的遗传因素。为了深入研究双相情感障碍的遗传基础，并探讨其与SZ和MDD的共享遗传机制，我们开发了BDgene数据库。该数据库主要有三个特点：（1）通过大量的文献阅读与信息提取，BDgene整合了来自779篇文献的多种类型的BD遗传因子，包括各类变异（单核苷酸多态性（SNP）、单体型、拷贝数变异（CNV）、以及其他类型的变异）、基因、基因-基因相互作用、染色体区域以及来自于基于通路的分析（PBA）的通路，这些数据为全面理解BD遗传学研究现状并进一步指导后继研究提供了广泛而可靠的数据集。（2）BDgene不仅整合了BD相关的遗传因子，还整合了来自于同时研究BD和SZ和/或MDD的疾病交叉研究（cross-disorder study）中SZ和MDD的结果，为进一步研究三者之间的关系提供基础。（3）基于文献数据，我们还进行了四方面的数据分析，包括对BD的候选基因进行优先级排序，以提供可靠候选用于验证研究；对BD的GWAS数据进行基于通路的分析，以获得更多疾病相关的通路；对来自于BDgene、SZGene和MK4MDD的基因进行交集分析，以获得更多疾病共享基因的候选；对排序后的核心基因以及来自于文献的阳性共享基因进行功能富集分析，探索这些关键基因在疾病的致病机理以及疾病共享机制中起到的作用。BDgene的构建将为BD及其相关疾病SZ和MDD的遗传学研究和致病机制研究提供重要的数据基础与指导。

学 科 :基因

资 源 类 型 :数据集

起 始 时 间 :2013-05-01 -

访 问 地 址 :http://bdgene.psych.ac.cn/